Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CebpbP28033 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms