Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2afxP27661 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2afxP27661 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2afxP27661 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2afxP27661 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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