Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ZfaP23607 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZfaP23607 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms