Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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