Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PparaP23204 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PparaP23204 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PparaP23204 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PparaP23204 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PparaP23204 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PparaP23204 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PparaP23204 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PparaP23204 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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PparaP23204 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PparaP23204 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PparaP23204 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PparaP23204 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PparaP23204 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PparaP23204 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PparaP23204 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PparaP23204 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PparaP23204 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PparaP23204 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PparaP23204 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PparaP23204 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PparaP23204 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PparaP23204 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PparaP23204 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PparaP23204 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PparaP23204 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PparaP23204 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PparaP23204 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PparaP23204 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PparaP23204 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PparaP23204 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PparaP23204 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms