Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms