Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P20040 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P20040 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms