Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18532 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18532 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18532 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18532 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18532 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18532 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18532 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18532 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18532 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18532 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P18532 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18532 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P18532 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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