Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Hoxb1P17919 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Hoxb1P17919 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Hoxb1P17919 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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