Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms