Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cd5P13379 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cd5P13379 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cd5P13379 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cd5P13379 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cd5P13379 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cd5P13379 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cd5P13379 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cd5P13379 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cd5P13379 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms