Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Arl14ep-202ENSMUST00000093883 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms