Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms