Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtaP09225 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtaP09225 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtaP09225 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtaP09225 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtaP09225 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtaP09225 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtaP09225 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtaP09225 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtaP09225 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtaP09225 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtaP09225 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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