Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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