Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06335 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06335 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06335 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06335 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06335 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06335 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06335 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06335 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms