Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06323 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06323 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06323 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06323 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06323 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06323 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06323 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06323 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06323 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06323 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06323 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06323 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06323 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06323 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06323 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06323 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06323 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06323 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06323 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06323 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06323 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P06323 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06323 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms