Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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