Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffaO54786 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffaO54786 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DffaO54786 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffaO54786 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffaO54786 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DffaO54786 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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DffaO54786 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffaO54786 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffaO54786 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DffaO54786 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffaO54786 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffaO54786 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffaO54786 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DffaO54786 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffaO54786 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffaO54786 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffaO54786 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DffaO54786 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffaO54786 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffaO54786 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffaO54786 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffaO54786 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffaO54786 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms