Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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