Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Sp100O35892 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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Sp100O35892 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Sp100O35892 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Sp100O35892 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Sp100O35892 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sp100O35892 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Sp100O35892 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Sp100O35892 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Sp100O35892 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Sp100O35892 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Sp100O35892 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Sp100O35892 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sp100O35892 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sp100O35892 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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