Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms