Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Cnih2O35089 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Cnih2O35089 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih2O35089 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms