Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms