Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Usp35M0QWN7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Usp35M0QWN7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Usp35M0QWN7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Usp35M0QWN7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Usp35M0QWN7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Usp35M0QWN7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Usp35M0QWN7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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Usp35M0QWN7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Usp35M0QWN7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp35M0QWN7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms