Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms