Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top6blJ3QMY9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Top6blJ3QMY9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Top6blJ3QMY9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Top6blJ3QMY9 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Top6blJ3QMY9 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Top6blJ3QMY9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Top6blJ3QMY9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Top6blJ3QMY9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Top6blJ3QMY9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Top6blJ3QMY9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Top6blJ3QMY9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Top6blJ3QMY9 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Top6blJ3QMY9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms