Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms