Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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