Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Usp9yF8VPU6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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