Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3371F7CQW8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms