Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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