Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf212F6TQD1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms