Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myo5cE9Q1F5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms