Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms