Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm17333C6EQI3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm17333C6EQI3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm17333C6EQI3 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm17333C6EQI3 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm17333C6EQI3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm17333C6EQI3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm17333C6EQI3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm17333C6EQI3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm17333C6EQI3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm17333C6EQI3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm17333C6EQI3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm17333C6EQI3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm17333C6EQI3 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm17333C6EQI3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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