Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rd3lB2RV38 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms