Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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PtprbB2RU80 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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PtprbB2RU80 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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PtprbB2RU80 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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PtprbB2RU80 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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PtprbB2RU80 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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PtprbB2RU80 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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PtprbB2RU80 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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PtprbB2RU80 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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PtprbB2RU80 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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PtprbB2RU80 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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PtprbB2RU80 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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PtprbB2RU80 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms