Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms