Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms