Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms