Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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Prr29B1ARI9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Prr29B1ARI9 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Prr29B1ARI9 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Prr29B1ARI9 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Prr29B1ARI9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Prr29B1ARI9 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Prr29B1ARI9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Prr29B1ARI9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Prr29B1ARI9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Prr29B1ARI9 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Prr29B1ARI9 Gm17026-201ENSMUST00000166674 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Gm17124-201ENSMUST00000168320 1379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Prr29B1ARI9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Prr29B1ARI9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Prr29B1ARI9 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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Prr29B1ARI9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Prr29B1ARI9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms