Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r232A2RTT5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r232A2RTT5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r232A2RTT5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r232A2RTT5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r232A2RTT5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r232A2RTT5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r232A2RTT5 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r232A2RTT5 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r232A2RTT5 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r232A2RTT5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r232A2RTT5 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms