Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms