Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ambra1A2AH22 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ambra1A2AH22 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ambra1A2AH22 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ambra1A2AH22 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ambra1A2AH22 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ambra1A2AH22 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ambra1A2AH22 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ambra1A2AH22 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ambra1A2AH22 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ambra1A2AH22 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ambra1A2AH22 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ambra1A2AH22 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ambra1A2AH22 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ambra1A2AH22 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ambra1A2AH22 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ambra1A2AH22 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms