Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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