Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skp2Q9Z0Z3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms