Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms