Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Nek3Q9R0A5 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Nek3Q9R0A5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Nek3Q9R0A5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Nek3Q9R0A5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Nek3Q9R0A5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Nek3Q9R0A5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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