Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms